在 Windows Server 2003 SP2 正式發布以后，經過 ISA Server 開發組的測試，發現在以下三個方面存在兼容性問題：

1、如果運行的是 ISA Server 2004 企業版，那么你必須先在配置存儲服務器上安裝ADAM SP1，然后才能安裝 Windows Server 2003 SP2，否則將會導致ISA Server 2004 無法正常啟動。ADAM SP1的下載地址為：

http://www.microsoft.com/downloads/details.aspx?FamilyId=9688F8B9-1034-4EF6-A3E5-2A2A57B5C8E4&displaylang=en

2、在 Windows Server 2003 SP2 中引入了新的中斷處理方式，但是在部分32位多處理器計算機上，如果CPU具有較高的利用率，那么可能會導致 ISA Server 的性能下降。如果出現這種問題，可以使用 Windows Server 2003 資源工具包中的中斷關聯工具進行修改。

中斷關聯工具（intfiltr.exe）下載地址為：

http://www.microsoft.com/downloads/details.aspx?FamilyID=9d467a69-57ff-4ae7-96ee-b18c4790cffd&DisplayLang=en

相關使用說明為：

http://support.microsoft.com/kb/252867

3、如果你的網絡適配器支持接收端調節（Receive-side Scaling）功能，那么在特定場景下可能出現NAT不能正常工作的情況，相關信息請參見

Windows Server 2003 SP2 與 NAT 的兼容性問題

http://www.isacn.org/info/info.php?sessid=&infoid=328